rsistin基因的克隆及载体的构建

来源:岁月联盟 作者:陈 梅,方伟祯,傅玉 时间:2010-07-14

【摘要】  目的:克隆小鼠resistin基因及其连载体的构建,为进一步研究resistin的功能打下基础。方法:根据报道的小鼠resistin基因的全长mRNA序列为目的基因,即提取小鼠脂肪组织中的RNA,以RNA为模板,在逆转录酶的作用下,逆转录(RT)合成resistinDNA,再在TaqDNA聚合酶的作用下聚合酶链反应(PCR)扩增resistin cDNA,将扩增PCR产物(resistin cDNA)经纯化后与A?T连接于pGEM?T载体,重组质粒转化JM 109感受态菌,蓝白斑筛选阳性菌落,摇菌、提取质粒。结果:提取的总RNA纯度A260/280为1.9,电泳条带28 s∶18 s比例约为2∶1,RT?PCR与欲扩增的目的片段的理论长度363 bp相符,重组质粒插入pGEM?T的DNA片段的核苷酸序列与小鼠resistin基因mRNA编码区序列完全一致。结论:成功克隆了小鼠resistin cDNA基因,为构建resistin基因打下基础。

【关键词】  小鼠resistin基因;载体;构建

  resisin又称抵抗素,可损害糖代谢,影响组织对胰岛素的敏感性[1],被认为可能是联系肥胖与Ⅱ型糖尿病的重要纽带[2,3]。小鼠resistin基因mRNA全长519个碱基,编码区(cds)是由84位至428位共345个碱基组成,编码114个氨基酸残基组成的resistin蛋白质。目前对resistin的生物功能了解甚少,为了探讨resistin的功能,本研究拟用RT?PGR技术从小鼠脂肪组织中扩增resistin cDNA,A/T克隆于pGEM?T载体。为进一步研究resistin功能及与糖尿病的关系奠定实验基础。

  1  材料与方法

  1.1  主要试剂  TRIol Reagent总RNA提取和THERMOSCRIPTTM RT?PCR System(购自GIBCOL BRL公司),PCG引物(由TakaRa Biotech公司合成)Qiaquick Gel Extraction Kit、Plasmid Qiaprep Spin Miinprep Kit和Endofree Plasmid Maxi Kit(购自QIAGEN公司),pGEM?T vector systemI(购自promega公司),限制性内切酶XbaI、EcoRI和NotI(购自ENB或MBI Fermenta或Rroche公司),T4DNA连接酶(购自Takara  Biotech公司),JM 109大肠杆菌由本院医学研究中心提供。

  1.2  方法

  1.2.1  总RNA测定  提取总RNA:取正常雄性BALB/C小鼠,16周龄,体重38 g(购自中山大学动物实验中心)。取其脂肪200 mg,按照一步法提取总RNA。检测总RNA:电泳检测总RNA质量;紫外分光光度法检测总RNA纯度和含量。RNA浓度:RNA=A260×40×稀释倍数。

  1.2.2  逆转录合成cDNA  按Mmnlv RT?PCR试剂盒说明书操作逆转录合成cDNA。

  1.2.3  PCR扩增resistin cDNA  PCR引物设计,根据小鼠resistin基因mRNA序列,用计算机软件设计引物,并在上、下游引物的5’端分别引入Eco R1和XbaⅠ酶切位点。上游引物:5'?CGGAATTCATGAACCTTTCATTTCC?3'(下划线的部分为Eco R1酶切位点);下游引物:5'?CTAGTCTAGATCAGGAAGCGACCTGCAGCT?3'(下划线的部分为XbaⅠ酶切位点);扩增resistin基因全长编码区序列,扩增片段理论长度为363 bp。在一个50 μl的反应体系中进行PCR,并对反应体系中RT产物、引物和MgCl2的量及热循环参数进行了数次优化,共同进行了35循环。2%的琼脂糖凝胶电泳成像。

  1.2.4  凝胶回收纯化PCR产物  按Qiaquick Gel Extraction Kit操作说明,凝胶电泳观察回收结果,紫外分光光度法检测DNA含量及纯度检测。

  1.2.5  受体感受态JM109菌的制备  用CaCl2法(0.1 M的进口CaCl2)制备感受态细胞。

  1.2.6  纯化PCR产物A?T连接于pGEM?T载体  按插入片段与载体的摩尔比为3∶1的量进行连接反应,总反应体系10 μl,置4 ℃冰箱过夜连接。

  1.2.7  连接反应液转化JM 109感受态菌液  连接DNA反应液10 μl,加入200 μl受体感受态菌液中,最后行蓝白斑筛选,挑选单个白色菌落,加入2 μl LB液体培养基中(含氨苄青霉素),37 ℃震荡增殖转化菌。

  1.2.8  提取重组质粒PGEM?T?reisitin  上述菌液扩增至生长晚期,按Qiaprep Spin Miniprep Kit操作说明提取质粒。凝胶电泳提取的重组质粒的质量和紫外分光光度法检测DNA含量及纯度检测。

  1.2.9  鉴定和保存重组质粒pGEM?T?reisitin  重组质粒pGEM?T?reisitin:双酶切鉴定(内切酶购自NEB公司),反应体系如下:pGEM?T?reisitin(0.35 μg/μl)5 μl、EcoRI1 μl、XbaⅠ1 μl、10×NEBuffer 2 μl、10×BSA 0.2 μl加三蒸水至20 μl,37 ℃水浴2 hr紫外灯下观察结果;核苷酸序列分析鉴定:重组T载体送TakaRa Biotech公司测序。

  2  结果

  2.1  判断总RNA的质量和浓度  提取的小鼠脂肪组织总RNA,经凝胶电泳后,紫外灯下呈现清淅的28 s、18 s、HE 5 s三条带,且28 s与18 s条带丰度比约为2∶1,说明总RNA无降解。A260/280为1.9,表明总RNA纯度高,总RNA浓度为0.5 μg/μl,总量15 μg。

  2.2  RT?PCR产物电泳分析  RT?PCR产物凝胶电泳后,紫外灯下可见一清晰的条带位于250 bp与500 bp,与欲扩增的目的片段的理论长度363 bp相符。

  2.3  重组质粒pGEM?T?reisitin酶切鉴定  重组质粒被EcoRⅠ和XbaⅠ内切酶切为两条带,片段的大小与理论值pGEM?T3000 bp和插入的目的片段363 bp相符。

  2.4  重组质粒pGEM?T?reisitin核苷酸序列分析  pGEM?T?reisitin核苷酸序列分析酶切位点图表明PCR产物已连于pGEM?T载体,插入pGEM?T的DNA片段的核苷酸序列顺向测序和反向测序均证明插入的DNA片段与小鼠reisitin基因mRNA编码区序列完全一致。

  3  讨论
  
  据报道reisitin基因仅在白色脂肪(WAT)中大量表达,且小鼠成年后较出生时reisitin mRNA表达增高。小鼠6周~9周性发育成熟,即进入成年期。本研究挑选16周的成年雄性小鼠,取其附睾周围及网膜的WAT用于提取总RNA,以使被取的脂肪组织reisitin表达丰度高,有利于通过RT?PFR扩增reisitin cDNA。RT?PCR产物凝胶电泳鉴定,扩增出一特异性条带,大小在250 bp与500 bp之间,与目的片段的理论长度363 bp相符。推测它是欲扩增的reisitin cDNA。由于PCR产物直接进行双酶切,难以判断酶切成功与否,盲目接着进行下一步连接反应,易造成时间和试剂的浪费。因此,本研究选用T载体作为过渡。因Taq聚合酶具有在PCE产物3端加A碱基的功能,T载体是人工改良的两头3末端加有T碱基开环的质粒,PCR产物与T载体经T4DNA连接酶A?T连接,可大大提高带有Lacz基因,可行蓝白斑筛选转化阳性菌落。GEM?T质粒是专门用于“A/T克隆”高考贝数的T载体,达到3 000 bp,其带有1个氨苄青霉素抗性基因用于筛选,有多克隆酶切位点,使插入的DNA片段可通过内切酶再取出。多克隆酶切位点两侧分别带有T7和SP两个反向的噬菌体的启动子,这种构架允许外源DNA的任一条链在体外得到转录。本研究重组质粒pGEM?T?reisitin进行双酶切后,凝胶电泳,紫外灯下可见重组质粒被切为3 000 bp和363 bp的两条带,表明RT?PCR产物已连于pGEM?T载体。重组pCEM?T质粒的核苷酸序列分析显示,插入pGEM?T的DNA片段的核苷酸序列与报道的小鼠resistin基因编码区序完全一致,表明resistin基因cDNA克隆成功。这为构建resistin基因提供了物质基础。

【】
    [1] Strppan CM,Brown EJ,Wright CM,et al.A family of tissues–pecific Resistin?like molecules[J].P Natl Acad USA,2001,98(2):502?506.

  [2] Senior K.Resistin links obesity to typeⅡdiabetes[J].Lancet,2001,357:202.

  [3] Steppan CM,bailey ST,Bhat S,et al.he homone resistin linds obesity to diabetes[J].Nature,2001,409:307?312.