四种纯化弓形虫速殖子方法对虫体RNA影响的比较
作者:杨秋林,许丽芳,伍和平
【摘要】 目的 比较纯化弓形虫速殖子的四种方法对虫体RNA的影响。方法 以2.0×105个速殖子腹腔接种于昆明小鼠,72h后收集小鼠腹腔液,以胰蛋白酶消化法、微孔滤膜过滤法、G3滤斗和CF-11纤维素柱法纯化弓形虫速殖子,用AGPC法抽提总RNA,用甲醛变性胶电泳检测总RNA。结果 胰蛋白酶消化法虫体回收率最大,但时间长,易造成RNA降解;微孔滤膜过滤法回收率低;G3滤斗纯度不高;CF-11纤维素柱法快速简单、纯度高,对RNA无影响。结论 微孔滤膜过滤法、CF-11纤维素柱法对虫体RNA的影响小,较适用于cDNA文库构建时虫体的分离纯化。
【关键词】 弓形虫,病;胰蛋白酶消化法;微孔滤膜过滤法;G3滤斗;CF-11纤维素柱法
为构建高质量的cDNA文库及在其它的一些研究中,必须在尽可能短的时间里从感染弓形虫的小鼠腹水中去除炎性细胞、腹腔细胞和红细胞,纯化弓形虫速殖子,以减少mRNA的降解。为此我们比较了四种不同的纯化方法对虫体RNA的影响,以期尽可能快地获得较纯的弓形虫速殖子,提取高质量的mRNA。
1 材料与方法
1.1 材料
1.1.1 弓形虫虫株 弓形虫昆山分离株由江苏省寄生虫病研究所王崇功教授赠送。
1.1.2 试剂 胰蛋白酶购自华美公司,微孔滤膜(直径3μm)、G3滤斗购自上海医药研究院。CF-11纤维素购自Whatman公司;其余试剂为国产分析纯。
1.2 方法
1.2.1 虫体的收集 以2.0×105个速殖子腹腔接种于昆明小鼠,72h后收集小鼠腹水,3000r/min离心8min,弃上清。
1.2.2 胰蛋白酶消化法 虫体中加入20倍量压积的0.25%~0.3%胰蛋白酶消化液,37℃消化30 min,PBS洗两次,沉淀如上法重复消化洗涤一次。镜检记数。
1.2.3 微孔滤膜过滤法 虫体中加适量PBS制备虫体悬液,过内装直径3μm 微孔滤膜的滤器,收集滤出液,离心。镜检记数。
1.2.4 G3滤斗 虫体悬液过G3滤斗,收集滤出液,离心,镜检。
1.2.5 CF-11纤维素 CF-11纤维素在PBS中4℃过夜,弃浮在上面的细颗粒,装柱约3cm高。加虫体悬液10ml,20ml PBS洗柱,收集滤出液,离心,镜检记数。
1.2.6 弓形虫速殖子总RNA的抽提 分别以AGPC法抽提以上四种方法纯化的虫体总RNA[1],75%乙醇洗涤总RNA沉淀三次后空气干燥10min,最后将总RNA沉淀溶于DEPC处理过的ddH2O中,用甲醛变性胶电泳检测总RNA[2]。
2 结果
2.1 四种方法的虫体回收率、白细胞清除率、红细胞清除率及所需时间 胰蛋白酶消化法虫体回收率最大,但时间长,易造成RNA降解;微孔滤膜过滤法回收率低;G3滤斗纯度不高;CF-11纤维素柱法快速简单、纯度高,对RNA无影响。见表1。
表1 四种纯化方法的比(略)
2.2 甲醛变性胶电泳检测总RNA结果
A 胰蛋白 酶消化法 B CF-11 纤维素 C 1.微孔滤膜过 滤法;2.G3滤斗
图1 用甲醛变性胶电泳鉴定弓形虫总RNA(略)
可见从用胰蛋白酶消化法(见图A)纯化的虫体中抽提的总 RNA在甲醛变性胶上呈弥漫一片,分子量偏小,说明RNA有降解。从用CF-11纤维素(见图B)、微孔滤膜过滤法(见图C1)和G3滤斗(见图C2)纯化的虫体抽提的总RNA在甲醛变性胶上可见28srRNA和18srRNA两条带,28srRNA的条带明显比18srRNA带亮,说明RNA没有降解。
3 讨论
提纯弓形虫的方法较多,各有优缺点[3]。胰蛋白酶消化法能破坏细胞,使胞内虫体释出,虫体回收率达140%,白细胞的清除率也高,可用于大量制备抗原。但所需时间长,工作量大,对mRNA的质量有影响,不适于cDNA文库的构建。微孔滤膜过滤法虽然能使虫体纯度最高,但回收率太低,且存在滤膜易破、分离量少等缺点,可能与膜的质量有关。G3滤斗法快速,但虫体的纯度不够,也可能与我们所购G3滤斗的孔径标准有关。CF-11纤维素法具有快速简单、纯度高等优点,虽然红细胞清除率低,但红细胞没有细胞核,对弓形虫mRNA的抽提影响不大。所以该法较适用于cDNA文库构建时虫体的分离纯化[4]。
【】
[1] Piotr Chomczynski and Nicoletta Sacchi.Single-Step method of RNA isolation by acid guanidinium thiocyanate-penol-chloroform extraction [J].Analytical Biochemistry 1987,162: 156-159.
[2] Lehrach H,D.Diamond JM,Wozney.RNA molecular weight determinations by gel electrophoresis under denaturing conditions,a critical reexamination [J].Biochemistry,1977,16: 4743.
[3] Robert P,Dempster.Toxoplasma gondii:purification of Zoites from peritoneal exudates by eight methods [J].Experimental parasitology,1984,57: 195-207.
[4] 杨秋林,陆惠民,邬敏辰,等.弓形虫昆山分离株速殖子期表达型cDNA的构建及鉴定[J].人兽共患病杂志,2000,(10):25-27.











