宫颈癌组织高危HPV18 L1基因的克隆及序列分析

来源:岁月联盟 作者:高艳娥 时间:2010-07-12

【摘要】  目的 克隆和分析人乳头瘤病毒18型晚期表达基因L1序列,为HPV感染的检测和基因工程疫苗研制提供基础。方法 采用PCR技术扩增了1例HPV18阳性宫颈腺癌患者癌组织中HPV18 L1基因,并对其进行了克隆及全序列分析。结果 本例宫颈癌临床标本HPV18 L1基因与GenBank收录的原型比较有12个碱基变异,推导其编码的氨基酸也发生了变化。结论 本例人宫颈癌HPV18 L1基因有一定的变异。

【关键词】  人乳头瘤病毒18型 L1基因 宫颈癌 克隆


  0  引言
   
  人乳头瘤病毒(human papillomavirus, HPV)感染是最常见的性传播疾病之一,至今,已发现100多型HPV,近半数可感染生殖道。其中,HPV 16、18、31、33、35和58 等型因与宫颈癌等恶性肿瘤的发生密切相关而归属高危群。
   
  虽然HPV18是世界大部分地区宫颈癌患者中次于HPV16的第二位常见高危HPV[1,2],但HPV18 较HPV16具有更强的恶性转化能力[3]。HPV感染的控制关键在于疫苗的发展。HPV晚期基因L1编码的病毒主要衣壳蛋白L1是病毒的重要抗原, 能刺激机体产生保护性抗体,故L1基因已被用于制备HPV疫苗[4]。由于HPV不能在体外经组织培养增殖,故而L1基因的克隆和表达对基因工程疫苗及诊断试剂的研制具有重要意义。本实验对来自陕西省的一例宫颈腺癌患者手术标本中的HPV18 L1基因进行了克隆及一级结构分析。

  1  材料与方法

  1.1  材料

  1.1.1  标本DNA  选取我们用TDI?FP分型方法[1]鉴定出的一例HPV18阳性宫颈癌DNA。患者源自西安大学第二妇产科,42岁。经病理诊断为腺癌, 按FIGO分期为Ⅱa期。取材前未接受化疗和放疗。

  1.1.2  菌株及主要试剂  DH5α大肠杆菌细胞株为第四军医大学全军基因诊断研究所保存,克隆载体连接试剂盒(pGEM??T Easy Vector System I,内有T4连接酶)和质粒提取试剂盒(Wizard?Plus Minipreps DNA Purification System)购自美国Promega公司,Taq DNA聚合酶、限制性内切酶Hind Ⅲ及SacⅠ、DNA marker(DL2000)、异丙基硫代?β?D?半乳糖苷(IPTG)和5?溴?4?氯?3?吲哚?β?D?半乳糖苷(X?gal)、dNTP混合物购自大连宝生物公司,电泳凝胶片段回收试剂盒(CONCERTTM Rapid Gel Extraction System)购自美国GIBCO公司。蛋白酶K、RNA酶购自洛阳华美生物工程公司。引物和寡核苷酸探针由北京赛百盛公司合成。

  1.2  方法

  1.2.1  PCR扩增HPV18 L1基因  HPV18 L1 ORF全长引物依据GenBank设计。上游引物外设SacⅠ酶切位点和保护碱基CG,下游引物外设Hind Ⅲ酶切位点和保护碱基GC。该引物扩增的靶序列全长1707bp。PCR以从宫颈癌组织中提取的总DNA作为模板, 总体系25μl, 内含dNTP0.25mmol·L-1,引物各0.25μmol·L-1,MgCl2 2.5mmol·L-1,Taq酶2.5U。扩增条件:94℃变性5min后,进行35个循环:94℃ 40s, 56℃ 40s, 72℃ 2min, 末次循环后72℃延伸7min。

  1.2.2  HPV18 L1基因的克隆和测序  将PCR产物经含溴化乙锭的1.5%琼脂糖凝胶电泳后,紫外灯下看到1707bp 的L1扩增带,将含有相应片段的凝胶切下置入1.5ml Eppendorf 管中,分别严格参照电泳凝胶片段回收试剂盒及克隆载体连接试剂盒(pGEM??T Easy Vector System I)说明回收目的片段,并将目的片段与克隆载体pGEM?T Easy连接,构建HPV18 L1?pGEM?T 重组质粒,转化至CaCl2 法制备的大肠杆菌DH5α感受态细胞中。在含有IPTG 和X?gal、氨苄青霉素阳性的LB琼脂平皿中蓝白筛选, 随机挑取3个白色单菌落扩大培养,按Wizard?Plus Minipreps DNA纯化试剂盒说明书步骤小量提取重组质粒,并进行酶Hind Ⅲ及SacⅠ双酶切鉴定。含有1707bp(L1)外源DNA片段的克隆为阳性克隆,送上海Sangon生物工程公司进行DNA序列测定,对测序结果进行分析。

  2  结果

  2.1  HPV18 L1基因的PCR扩增  从宫颈癌组织中提取的总DNA作为模板,用合成的 HPV18 L1引物进行PCR扩增,产物在1.5%的琼脂糖凝胶电泳分析,可见一条清晰的扩增带,见图1,与预计的片段大小一致,为1 700bp左右。

  2.2  重组质粒的构建及双酶切鉴定  目的片段回收后与线性克隆载体pGEM?T Easy连接,构建了HPV18 L1?pGEM?T重组质粒。将重组质粒经转化及HindⅢ和SacⅠ双酶切鉴定筛选出阳性克隆。酶切电泳结果如图2,可见重组质粒的插入片段与预计的1 707bp片段大小一致。

  图1  HPV18 L1基因PCR产物的电泳分析(略)

  图2  重组质粒HPV18 L1?pGEM?T 的双酶切鉴定(略)
  
  2.3  重组质粒的序列测定和分析  将含重组质粒的阳性克隆经上海Sangon生物工程公司自动测序仪行正、反双向测定,拼接出L1完整序列,推导出相应的 L1蛋白质氨基酸序列。经blast同源性分析证实,克隆获得的HPV18 L1基因从起始密码子(ATG)到终止密码子(TAA)共1 707bp, 与GenBank收录的(收录号: X05015 )、由Cole等[5]报道的原型(prototype)比较,有12个碱基发生了变异,推导其蛋白质一级结构中可能有11个氨基酸发生改变,见表1。

  3  讨论
   
  近20年来对宫颈癌的病因及癌变机制的研究表明HPV是宫颈癌的主要致癌因素,近99%的宫颈癌组织中可检出HPV DNA。HPV16和HPV18是宫颈癌中最常见的高危型HPV,检出率达50%~90%[1, 2]。
   
  体外研究发现,与HPV16相比,HPV18的恶性转化及使细胞永生化的能力更强[3]。据报道HPV18相关的宫颈癌癌前病变进程更快[6]。HPV18也是宫颈癌再发的独立危险因素[7],且与宫颈腺癌显著相关[8],HPV18相关宫颈癌早期诊断率低、预后差。因此,控制HPV18感染必将能减少HPV18感染相关肿瘤的病死率。

  表1  宫颈腺癌样本中HPV18 L1基因突变分析(略)

  到目前为止,对HPV感染所致的疾病尚无特异的抗病毒方法,其控制关键在于开发HPV疫苗。由于HPV不能在体外培养增殖,相关基因/蛋白的获得只能依赖基因工程重组及表达系统。HPV晚期基因L1编码的病毒主要衣壳蛋白L1是HPV的重要抗原,多种HPV重组L1蛋白能够自发折叠成病毒样颗粒(VLP),免疫机体后可刺激B淋巴细胞产生中和抗体,从而阻断HPV病毒感染,故而L1基因及蛋白已成为基因工程疫苗研制的重要靶向基因和蛋白[4]。
   
  已知各型HPV有多种变种(variant)存在,即HPV基因呈高度多态性,这种多态性与地理位置有关,且因人群遗传背景差异而与疾病的相关关系不同[9]。本例HPV18 L1基因序列较GenBank收录的源自巴西的原型[5]比较有12个碱基发生突变,推导出的L1蛋白一级结构中的氨基酸11个发生了变化。L1基因变异导致的L1蛋白一级结构变化对蛋白功能,尤其蛋白免疫原性的影响尚需深入研究。在对HPV检测及疫苗研制时应考虑到基因变异可能的影响。
   
  本实验从西安地区1例宫颈腺癌患者临床标本中成功地克隆到了HPV18型L1基因,该基因的成功克隆为其相应蛋白表达的后续工作奠定了基础,并对疫苗的进一步研制,以及开发具有诊断或预防功能的生物制剂都具有重大意义。

【】
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  [2] Clifford GM, Rana RK, Franceschi S, et al. Human papillomavirus genotype distribution in low?grade cervical lesions: comparison by geographic region and with cervical cancer[J]. Cancer Epidemiol Biomarkers Prev, 2005, 14(5): 1157?1164.

  [3] Villa LL, Schlegel R. Differences in transformation activity between HPV 18 and HPV 16 map to the viral LCR?E6?E7 region[J]. Virology, 1991, 181(1): 374?377.

  [4] Yuan H, Estes PA, Chen Y, et al. Immunization with a pentameric L1 fusion protein protects against papillomavirus infection[J]. J Virol, 2001, 75(17): 7848?7853.

  [5] Cole ST,Danos O. Nucleotide sequence and comparative analysis of the human papillomavirus type 18 genome[J]. J Mol Biol, 1987, 193(4): 599?608.

  [6] Kurman RJ, Schiffman MH, Lancaster WD, et al. Analysis of individual HPV types in cervical neoplasia: a possible role for type 18 in rapid progression[J]. Am J Obstet Gynecol, 1988, 195(2): 293?296.

  [7] Rose BR, Thompson CH, Simpson JM, et al. Human papillovirus DNA as a prognostic indicator in early stage cervical cancer: a possible role for type 18[J]. Am J Obstet Gynecol, 1995, 173(5): 1461?1468.

  [8] Kim JW, Cho YH, Lee CG, et al. Human papillomavirus infection and TP53 gene mutation in primary cervical carcinoma[J]. Acta Oncol, 1997, 36(3): 295?300.

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